Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trub1Q8C0D0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trub1Q8C0D0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub1Q8C0D0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms