Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot10Q8BH15 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot10Q8BH15 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot10Q8BH15 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnot10Q8BH15 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnot10Q8BH15 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnot10Q8BH15 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot10Q8BH15 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot10Q8BH15 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot10Q8BH15 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot10Q8BH15 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot10Q8BH15 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot10Q8BH15 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot10Q8BH15 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot10Q8BH15 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot10Q8BH15 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms