Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sys1Q78S06 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sys1Q78S06 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms