Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2d2bQ6ZWY6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2d2bQ6ZWY6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms