Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnt1Q6ZPR4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnt1Q6ZPR4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnt1Q6ZPR4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnt1Q6ZPR4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnt1Q6ZPR4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnt1Q6ZPR4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnt1Q6ZPR4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnt1Q6ZPR4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms