Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptx4Q6RUU0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx4Q6RUU0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx4Q6RUU0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx4Q6RUU0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx4Q6RUU0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx4Q6RUU0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx4Q6RUU0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx4Q6RUU0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptx4Q6RUU0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptx4Q6RUU0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptx4Q6RUU0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptx4Q6RUU0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms