Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hmgb4Q6P8W9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmgb4Q6P8W9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms