Protein–RNA interactions for Protein: Q62417

Sorbs1, Sorbin and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs1Q62417 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sorbs1Q62417 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sorbs1Q62417 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sorbs1Q62417 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151 ms