Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Samhd1Q60710 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Samhd1Q60710 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samhd1Q60710 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms