Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlha9Q5RJB0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bhlha9Q5RJB0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms