Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy3Q5DTK1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy3Q5DTK1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy3Q5DTK1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy3Q5DTK1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy3Q5DTK1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy3Q5DTK1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy3Q5DTK1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy3Q5DTK1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chsy3Q5DTK1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chsy3Q5DTK1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chsy3Q5DTK1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms