Protein–RNA interactions for Protein: Q4LFA9

Sema3g, Semaphorin-3G, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3gQ4LFA9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3gQ4LFA9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3gQ4LFA9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3gQ4LFA9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3gQ4LFA9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3gQ4LFA9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3gQ4LFA9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3gQ4LFA9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3gQ4LFA9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3gQ4LFA9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3gQ4LFA9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3gQ4LFA9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3gQ4LFA9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3gQ4LFA9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema3gQ4LFA9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3gQ4LFA9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3gQ4LFA9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3gQ4LFA9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3gQ4LFA9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3gQ4LFA9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3gQ4LFA9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema3gQ4LFA9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms