Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim40Q3UWA4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim40Q3UWA4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim40Q3UWA4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim40Q3UWA4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim40Q3UWA4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim40Q3UWA4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim40Q3UWA4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim40Q3UWA4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim40Q3UWA4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim40Q3UWA4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim40Q3UWA4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim40Q3UWA4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim40Q3UWA4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim40Q3UWA4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim40Q3UWA4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim40Q3UWA4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms