Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn4Q3UV66 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn4Q3UV66 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms