Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ell2Q3UKU1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms