Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE70

Gm21748, Predicted gene, 21748, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21748Q3UE70 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21748Q3UE70 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21748Q3UE70 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21748Q3UE70 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms