Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trmt1Q3TX08 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms