Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HmmrQ00547 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HmmrQ00547 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms