Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rad50P70388 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rad50P70388 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rad50P70388 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rad50P70388 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rad50P70388 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad50P70388 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rad50P70388 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad50P70388 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad50P70388 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad50P70388 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad50P70388 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rad50P70388 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rad50P70388 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms