Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Lrig1P70193 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrig1P70193 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms