Protein–RNA interactions for Protein: P70174

Hrh1, Histamine H1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh1P70174 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hrh1P70174 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hrh1P70174 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hrh1P70174 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms