Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CebpaP53566 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CebpaP53566 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CebpaP53566 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CebpaP53566 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CebpaP53566 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CebpaP53566 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CebpaP53566 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CebpaP53566 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CebpaP53566 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms