Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn1P35821 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn1P35821 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn1P35821 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn1P35821 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ptpn1P35821 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn1P35821 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn1P35821 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn1P35821 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn1P35821 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn1P35821 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms