Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav1P27870 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav1P27870 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vav1P27870 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vav1P27870 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vav1P27870 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vav1P27870 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav1P27870 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav1P27870 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms