Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkcaP20444 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcaP20444 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms