Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh1P04444 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hbb-bh1P04444 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms