Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt1P04104 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt1P04104 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt1P04104 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt1P04104 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt1P04104 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt1P04104 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt1P04104 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt1P04104 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms