Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01853 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01853 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01853 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01853 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01853 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01853 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01853 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01853 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01853 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01853 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01853 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01853 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01853 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01853 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01853 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01853 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01853 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01853 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01853 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01853 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01853 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01853 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01853 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01853 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01853 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01853 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01853 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01853 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01853 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01853 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01853 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01853 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01853 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01853 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01853 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01853 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01853 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01853 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01853 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01853 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01853 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01853 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01853 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01853 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01853 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01853 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01853 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01853 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01853 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01853 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01853 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01853 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01853 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01853 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01853 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01853 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01853 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01853 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01853 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01853 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01853 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01853 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01853 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01853 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01853 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01853 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01853 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01853 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01853 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01853 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01853 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01853 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01853 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01853 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms