Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpd52l1O54818 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpd52l1O54818 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms