Protein–RNA interactions for Protein: O54743

Foxf2, Forkhead box protein F2, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf2O54743 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxf2O54743 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxf2O54743 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxf2O54743 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxf2O54743 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxf2O54743 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxf2O54743 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxf2O54743 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxf2O54743 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxf2O54743 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxf2O54743 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxf2O54743 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxf2O54743 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxf2O54743 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxf2O54743 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms