Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc27a2O35488 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc27a2O35488 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms