Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt1O35449 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrt1O35449 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms