Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc191J3QQ27 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc191J3QQ27 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc191J3QQ27 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms