Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Speer4cG3UXD1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Speer4cG3UXD1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Speer4cG3UXD1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Speer4cG3UXD1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Speer4cG3UXD1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Speer4cG3UXD1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Speer4cG3UXD1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Speer4cG3UXD1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Speer4cG3UXD1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Speer4cG3UXD1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Speer4cG3UXD1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4cG3UXD1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms