Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2237E9Q501 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2237E9Q501 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2237E9Q501 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163 ms