Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms