Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Skor2A7M7C7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Skor2A7M7C7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skor2A7M7C7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor2A7M7C7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms