Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3550W4VSN7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms