Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vstm4T1NXB5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms