Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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