Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip6Q9Z1Y4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms