Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf4Q9QZS2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf4Q9QZS2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf4Q9QZS2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms