Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp21Q9QZL6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Usp21Q9QZL6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp21Q9QZL6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms