Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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VapbQ9QY76 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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VapbQ9QY76 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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VapbQ9QY76 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VapbQ9QY76 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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