Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tgm1Q9JLF6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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