Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DysfQ9ESD7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms