Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms