Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cnn3Q9DAW9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms