Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2310002L09RikQ9D7L5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms