Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sdr42e1Q9D665 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sdr42e1Q9D665 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sdr42e1Q9D665 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdr42e1Q9D665 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sdr42e1Q9D665 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdr42e1Q9D665 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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